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Camps C, Kappel C, Lecomte P, Léon C, Coutos-Thévenot P, Delrot S, Gomès E (2014)

Identification of grapevine marker genes for early, non-destructive Eutypa lata infection diagnosis. Plant Pathology, 63 (2) 323-333.

Résumé (traduction par nos soins) :

Eutypa lata est le champignon responsable de l'eutypiose, une maladie dégradant le bois et affectant toutes les régions viticoles, sans traitement curatif disponible actuellement et sans méthode de diagnostic précoce non destructive. Ce travail vise a rechercher les gènes de la vigne exprimés en réponse à la présence d'Eutypa lata et qui pourraient utilisés dans un outil de diagnostic précoce, avant l'apparition des symptômes foliaires de la maladie et qui serait non destructif, utilisant uniquement des prélèvements foliaires. Des analyses microarray ont été réalisées à partir de

1) plantes infectées et montrant des symptômes foliaires et vasculaires caractéristiques et recelant le pathogène dans les lésions vasculaires (S+R+),

2) plantes infectées et ne montrant pas de symptômes (SR+),

3) plantes sans symptômes et sans présence de pathogène (SR).

Des plants issus du vignoble ou des plantes cultivées en serre, naturellement ou artificiellement inoculées ainsi que des témoins non inoculés sont caractérisées et l'ARN des feuilles est hybridé par microarrays (15000 gènes de vigne).

Parmi les différents gènes qui s'expriment chez les plants  SR+ et SR issus de serre ou du vignoble, 10 se révèlent être des candidats sérieux pour le diagnostic : 7 sont plus spécialement impliqués dans la réponse à l'infection et 3 sont associés à l'absence de symptômes. Dans un test qRT-PCR réalisé sur de l'ARN extrait de feuilles de vignes provenant de serre ou du vignoble, cinq gènes se révèlent être de bons marqueurs utilisables pour le diagnostic. De plus, leurs profils d'expression en réponse à une infection par E. lata ou d'autres champignons pathogènes majeurs de la vigne (Erysiphe necator, Plasmopara viticola, Botrytis cinerea) peuvent être différenciés.

La pertinence de l'utilisation de ces gènes pour développer une méthode précoce de diagnostic non destructive de l'infection par E. lata est discutée en comparaison avec les avantages et les inconvénients des études précédentes sur le diagnostic de E. lata.

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